Te lo muestro en imagenes al seteo que realizo...
1) Seteo de Indesign para pliego de dos A4
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2) Configuracion de impresión tipo folleto
3) Configuración del PDF Creator (para mi acá debe estar el problema)
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4) Cuadro maldito que anuncia el problema.. jajaja
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Espero ahora se entienda bien

, gracias!