Creo que tendrá que ser con AJAX:
Código:
<html>
<head>
<script type="text/javascript" src="http://ajax.googleapis.com/ajax/libs/jquery/1.6.4/jquery.min.js"></script>
<script type="text/javascript">
$(document).ready(function(){
$('.enlaceInterno').click(function(event){
event.preventDefault();
var href = $(this).attr("href");
$('#principal').load(href);
});
});
</script>
</head>
<body>
<div id="reproductor">Aquí el reproducto. Probandooo:<?php echo time(); ?></div>
<div id="principal">
Aquí va el resto de la web
<a href="pagina2.php" class="enlaceInterno">Ir a pagina2.php</a>
</div>
</body>
</html>