A ver, con que formato estas trabajando ? yml, xml o annotations ?, por que según la configuración que posteaste estas trabajando con annotations, si es con yml debes configurar el driver correspondiente y setearle el path a los yml.
Código INI:
Ver originalresources.doctrine.orm.entityManagers.default.metadataDrivers.drivers.0.adapterClass = "Doctrine\ORM\Mapping\Driver\YamlDriver"
resources.doctrine.orm.entityManagers.default.metadataDrivers.drivers.0.mappingDirs[] = "path/to/yml"