Solucionado tan facil como antes de tratar la web con DOM se remplaza la codificacion y listo.
Código PHP:
$doc= new DOMDocument();//Creamos el objeto DOM
libxml_use_internal_errors(true);//Evito aparicion de errores.
$loadWebUTF=str_replace("iso-8859-1", "UTF-8", $loadWeb);
$doc->loadHTML($loadWebUTF);//Carga del objeto DOM en HTML