si vas a reprducirlo en un dvd te va a tocar montar un dvd con sus menus y demas historias
pero si es para abrirlo desde un ordenador tienes que exportarlo como un exe y hacer un cd autoejecutable
http://www.desarrolloweb.com/faq/151.php
y lo de la resolucion lo haría directamente a 1280x720 para mantener la proporción de hd ready y fullhd y aprovechando que flash puede redimensionar el contenido manteniendo proporción no habrá problema.
Envuelves tu película con un marco negro al rededor del escenario para que se vea como las películas con las bandas negras cuando lo necesite y ya está