Hola,
Sobre la primera pregunta, consulta con tu proveedor acerca de la opción
addon domains. Algo parecido comenté en este otro mensaje:
http://www.forosdelweb.com/f93/mostr...3/#post3988221
Sobre la segunda pregunta, sí, cada instalación de Wordpress es independiente y debes instalarle las plantillas y plugins de manera independiente.
Por cierto, este mensaje tuyo nada tiene qué ver con "Manejando una empresa de hosting". Pediré a un moderador que lo mueva hacia el foro de Web Hosting.