mostrar las dos ciudades (dir empresa y fiscal) de una empresa

[gnzsoloyo]

Llamas cuatro veces a la tabla "usuarios", pero sólo existen dos campos con que relacionarla. Dos de las llamadas son innecesarias.
Además, ten en cuenta que el uso de los INNEER JOIN obliga a que todos las condiciones se cumplan si o si. Si una de las tablas vinculadas por INNER JOIN no se cumple, no devolverá ningún resultado.
Prueba así:

Código MySQL:

SELECT 
    EM.em_id,
    Em.em_foto,
    EM.em_foliosol,
    EM.em_nombrecom,
    EM.em_razonsocial,
    EM.us_id2,
    US.us_nombre Aplicante,
    US1.us_nombre Solicitante,
    EM.em_dir1,
    EM.em_tel1,
    EM.em_tel2,
    CI1.ci_nombre Ciudad,
    EM.em_cp,
    SC.sc_descr,
    EM.em_rfc, 
    EM.em_dirf, 
    CI2.ci_nombre 'Ciudad Fiscal',
    EM.em_contacto,
    EM.em_email, 
    EM.em_webpage,
    EM.em_afiliacion,
    EM.em_vigencia,
    EM.em_costo,
    Em.em_comentarios, 
    IF(EM.em_propdiseno=TRUE,'Si','No') em_propdiseno, 
    EM.em_formapago,
    EM.em_fechaafil,
    SB.sb_nombre 
 FROM 
    empresas EM 
    INNER JOIN ciudades CI1 ON EM.ci_id = CI1.ci_id 
    LEFT JOIN ciudades CI2 ON EM.ci_id = CI2.ci_idf
    INNER JOIN subcategorias SB ON EM.sb_id = SB.sb_id 
    INNER JOIN estatus_clientes SC ON EM.sc_id = SC.sc_id
    INNER JOIN usuarios US ON EM.us_id = US.us_id 
    INNER JOIN usuarios US1 ON EM.us_id = US1.us_id2 AND US.us_id=US1.us_id2 
WHERE 
    US.us_id=8;
 

Si esto falla, ve paulatinamente, desde la relación más simple, y agregale de a una tabla por vez, para ver con cual ya no devuelve datos.
Empieza entonces por acá:

Código MySQL:

SELECT 
    EM.em_id,
    Em.em_foto,
    EM.em_foliosol,
    EM.em_nombrecom,
    EM.em_razonsocial,
    EM.us_id2,
    US.us_nombre Aplicante,
    EM.em_dir1,
    EM.em_tel1,
    EM.em_tel2,
    EM.em_cp,
    EM.em_rfc, 
    EM.em_dirf, 
    EM.em_contacto,
    EM.em_email, 
    EM.em_webpage,
    EM.em_afiliacion,
    EM.em_vigencia,
    EM.em_costo,
    Em.em_comentarios, 
    IF(EM.em_propdiseno=TRUE,'Si','No') em_propdiseno, 
    EM.em_formapago,
    EM.em_fechaafil
 FROM 
    empresas EM 
    INNER JOIN usuarios US ON EM.us_id = US.us_id 
WHERE 
    US.us_id=8;
 

y ve agregando una tabla por vez. No intentes sacar todo de una sola vez.