porque no me cambia los datos de mi funcion

[refreegrata]

Creo que no consigo captar totalmente lo que quieres, pero al hacer el "eval" de la respuesta JSON vas a tener un array completo. Y recorriendo ese de 2 en 2 puedes lograr el efecto, editando MostrarRegistros, usando setInterval y lo que necesites.

Ahora, si por el contrario, la consulta sql devuelve demasiados registros y no los quieres recibir todos de un sólo paraguaso puedes hacer múltiples llamadas a "recuperar.php" en el cuál deberías hacer la consulta con un LIMIT 2 y un OFFSET, pasado como para adicional en la url, junto al código. Y cuando ya no haya más registros, desde "recuperar.php" devolver alguna especie de bandera indicando tal situación, para así dejar de realizar llamadas. Y obviamente jugar con setInterval en "funcion.js" donde corresponda.