Creo que tiene que ver mas con los recursos con los que contas en tu servidor, donde hosteas. Fijate porque por ejemplo si es muy poco volumen el que tenes que manejar una base de datos relacional y realmente muy utilizada en nodos de pocos recursos fue siempre.
http://hsqldb.org/
Ahora si el volumen de informacion crece sonaste, vas a tener que migrar a un motor mas potente seguro.