No hay necesidad de usar Javascript, para algo estan las variables GET.
Código HTML:
Ver original <li><a href="pagina.php?apartado=1">Apartado1
</a></li> <li><a href="pagina.php?apartado=2">Apartado2
</a></li> <li><a href="pagina.php?apartado=3">Apartado3
</a></li>
Luego en tu script lo recoges haciendo:
$_GET['apartado']