No hay en el mercado mejores programas para maquetar que InDesign y QXP, así que vas por buen camino. Por lo que veo en tu ejemplo es que tienes un cuadro blanco encina de la página y es tan simple como borrarlo y listo. Si no lo puedes "seleccionar" con el puntero, probablemente el recuadro está incrustado en tu página maestra y por eso no lo puedes borrar. Ve a tu página maestra y borra el cuadro para que aparezca el fondo de color que tienes en tu revista.
Otra cosa que podría ser es que tu documento está en capas o "layers" y el recuadro blanco está en uno de esas capas. La solución sería mover la capa del recuadro blanco "atrás" de las otras capas visibles o desactivar esa capa o borrarla toda junta para que desaparezca. No se me ocurre otra cosa por la cual salga ese recuadro blanco en tu diseño. InDesign no hace eso a menos que ese recuadro este hecho en las preferencias que tengas en tu programa como "default".
Espero que eso resuelva tu problema a menos de que el programa este mal instalado o sea
piratín, ja, ja. ¿Que versión de CS tienes?