Google valora todos los enlacs, tanto internos como externos. Obviamente no todos tienen el mismo peso o valor. No se si termino de comprender que entiendes por una página secundaria, si es una página tipo "intercambio de enlaces" MALO, pues cuanto mayor sea el nº de enlaces salientes mayor es el riesgo de que Google catalogue esa página / dominio como una granja de enlaces.
Por otro lado, el intercambio de enlaces no es que este mal visto... es que no esta recomendado por Google o por lo menos, abusar de este tipo de técnicas para conseguir enlaces entrantes.
Cita: Y por ultimo sirven de algo los enlaces que muchas web archivan en una base de datos y que aparecen en una especie de buscador ?
En realidad a mi entender los robot de Google no los debería detectar.
Lo siento, pero mi imaginación a estas horas de la tarde esta algo ... truncada... no termino de comprender a que tipo de páginas te refieres ¿directorios? ¿marcadores sociales?
Saludines