si le pones position absolute al sub menu no afecta al menú principal, no deberías tener problemas en que se mantenga centrado
Código CSS:
Ver original#nav li ul { margin:0px; padding:0px; display:none;position:absolute;}
aunque como consecuencia tendrás que crear una regla para darle un color de fondo ya que con position:absolute se sale del flujo y su elemento padre no crece y por lo tanto no tiene un color de fondo