buenas,
limite de ciclo no creo que existe. en mi experiencia, lo único que puede limitar un script es el recurso disponible. supongo que en tu caso estas consumiendo demasiada memoria. y si no es por disponibilidad de memoria, lo último que se me ocurre es que algo mal escrito tienes en los parámetros suministrados. mi recomendación, intenta por rangos. es decir, los primeros tantos, y luego los próximos tantos. si todo marcha bien, seguramente debe ser por limite de memoria.