Esto es lo que yo hago, en mi bootstrap:
Código PHP:
Ver originalprotected function _initJQuery()
{
$this->bootstrap('view');
$View = $this->getResource('view');
$View->addHelperPath('ZendX/JQuery/View/Helper/', 'ZendX_JQuery_View_Helper');
$View->jQuery()
->setLocalPath('/js/jquery-1.3.2.min.js')
->setUiLocalPath('/js/jquery-ui-1.7.1.custom.min.js')
->addStylesheet('/css/theme/jquery-ui-1.7.1.custom.css');
}
En mi Layout:
Con eso deberia de funcionar sin problemas.
Saludos.