Si la unidad se a desinfectado de forma correcta, prueba realizar un ultimo análisis Online de tu unidad con:
http://www.bitdefender.es/scanner/online/free.html
Si este proceso no detecta ninguna infección tu unidad esta desinfectada al 100%.
Siendo asín, protege tu unidad con software como Mx One Antivirus, Panda USB Vaccine, USB Doctor,