A ver si entiendo, en un folio vos tenes varios docs (Acta de Nacimiento, de Primaria, de Secundaria, etc..).
Lo que vos buscas es saber que documentos tenes para X folio?.
Por ejemplo, si el folio N tiene solo acta de nacimiento, deberías imprimir los checkboxs de todos los docs, pero el de acta tildado?.
Si es así, es sencillo.
Te hago una explicación breve y muy por arriba. Obtienes un número de folio de la bd, en base a ese numero podrás averiguar que documentos posee, cuando imprimas los checkboxs, a los documentos que ya tenes le pones el valor "checked" así:
Se entiende? o no entendí yo?? jeje
Saludos