Hola,
En
http://ip-to-country.com/database/ te indican el formato de la tabla y te dicen que el fichero es un CSV. Los administradores de BD normalmente tienen la opcion de importar ficheros CVS (phpMyAdmin, por ejemplo). Y si no, siempre puedes crear un script que lea el fichero y realice las consultas de insercion. Para ello puedes usar la funcion
fgetcsv()
Suerte.