mysql -ut
suario -ptu_password tu_base_de_datos < /path/a/tu/archivo.sql
Es importante que indiques bien la ruta del archivo. Si lo subes comprimido, descomprímelo antes.
Si desde tu máquina local puedes acceder a la remota, usa esto:
mysql -hhost_remoto -uusuario_remoto -ppassword_remoto base_de_datos_remota < /ruta/archivolocal.sql