a mi me funcionó esto:
en la ventana que se muestran en el greybox puse 2 botones: una para recargar el padre y la otra para cerrar el greybox :
<input type="submit" name="generar" value="Generar" onclick="top.window.location.href='index2.php'"/>
<input type="button" name="cancelar" value="Cancelar" onclick="parent.parent.GB_hide();" />
la pagina padres index2.php y llama al greybox asi:
<a href="nuevo.php" onclick="return GB_showCenter('NUEVO', this.href,150,300)">Nuevo</a>
Espero les sirva..
