Podrías usar algo así:
Código PHP:
$directorio=opendir(getcwd());
$actual = "cadena a reemplazar";
$cambio = "nueva cadena o dejar vació";
while ($archivo = readdir($directorio)){
$ter = getcwd()."/".$archivo;
$file = $ter;
$archivo = file_get_contents($file);
$cadena = str_replace($actual,$cambio,$archivo);
$echo = file_put_contents($file,$cadena);
if ($echo)
echo "<b>echo:</b> $ter <br/>";
}
closedir($directorio);
Pero eso solo funciona para los archivos que tangan permisos de escritura, si no mostrara un error.
Ademas solo funciona para los archivos que estén en mismo directorio que el actual.