restar dos fechas

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OK bien, debes saber que para usar fechas en JavaScript existe el objeto Date, así, con la primera en mayúscula. Ese objeto tiene un método llamada getTime, el cual devuelve el número de milisegundos transcurridos desde el 1ro de Enero de 1970 a la fecha y hora actual. Varios lenguajes de programación trabajan con ese concepto que se llama "timestamp" cuando no está dando en milisegundos sino en segundos. OK, obtienes esos número por cada fecha y luego los restas, con eso nomas se resuelven tus problemas porque tú solo quieres saber si una fecha anterior a la otra. Ahora bien, tu problema estaría en cómo construyes esa fecha en base al contenido de un par de inputs. Bueno, busca en la Red: "JavaScript objeto Date" verás información y ejemplos. Con eso podrás aprender, porque si te doy el código, vas a copiar y pegar y te vas a perder las demás funciones del objeto Date. Suerte.