Mi intención no es polemizar sobre este tema, de hecho les doy la razón en que estas ventanas no son completamente modales (aunque actúan como tal, por lo ya explicado anteriormente)
Cita:
Iniciado por laratik 
"Permite alternar el foco a otras ventanas del sistema, pero no a la ventana que le da origen ("ventana madre") hasta que se toma una acción sobre ella", como dices las estándar son: alert, confirm y prompt, pero lamentablemente en el entorno web no existe algo como el JDialog en java, en donde puedes crear una ventana modal con el contenido que desees.
Es claro que al no estar definidas como ventanas modales dentro del lenguaje (tal como sucede con la clases, no existen en javascript, pero se simulan), no se puede detener el flujo del programa, pero si bloquea el acceso a la ventana madre. En conclusión creo que el termino pseudomodales (aunque no lo había escuchado antes, he escuchado
pseudomonadales y eso no tiene nada que ver) esta más acorde, aunque para investigación es mejor utilizar la palabra modal. Gracias y nuevamente saludos.