La verdad no sé mucho de update. Te paso este link:
http://dev.mysql.com/doc/refman/5.0/es/update.html.
Supongo que el error es poner
$total entre paréntesis
Probá así:
Update Lote Set DiasEntrada=$total
Espero que te sirva
Saludos
Edito: jeje ahora que actualizo la página y leo la respuesta de @vgonga1986 creo que tiene toda la razón
