Tendría que revisar si los mapeos no se pierden o también intentar realizar el copy o xcopy con las rutas directas de los equipos, o sea:
xcopy E:\InSQL\ \\<PC o IP del equipo>\recurso compartido.
Estoy suponiendo que E es una partición local del equipo donde se ejecuta el bat.
Otra solución podría ser utilizar un programa que te ejecute esa tarea. Te recomiendo el Karen's Replicator.