Hace mucho que no uso IIS
Al parecer tu servidor ni siquiera está procesando los php, me parece que más que un problema de php.ini es un problema de instalación general.
Hay pequeñas pero importantes diferencias según la version de Windows/php/IIS que estés usando, te sugiero que te des una vuelta primero por
http://www.php.net/manual/es/install.windows.php
y veas que se ajusta mejor a tu caso
saludos