Cita:
Iniciado por Minipimer 
También está el tema de que redirijas www . misitio . com y http: / / misitio . com hacia uno de los dos (el que más te guste), así le quitas a Google la tentativa de verlo como contenido duplicado, quizá te ayude para lo otro.
Me alegro de que se resolviera el tema, yo también venía a decir lo mismo que ha dicho minipimer :)
Y ya que funciona, ¿hiciste esto o lo dejaste como estaba?