Hola,
Yo creo que sí se puede, haciedo uso de VBA.
Desde access puedes crear un objeto excel
Código:
Dim xls As Object
' abro una instancia de Excel
Set xls = CreateObject("Excel.Application")
' con ella abro el libro creado al exportar
xls.Workbooks.Open (ruta)
' lo hago visible o no
xls.Visible = False
' activo la Hoja 1
xls.Worksheets(1).Activate
La variable ruta contiene la ruta de acceso al archivo a abrir
A partir de la última línea imagino que puedes seguir ya que me dices que en excel tienes una macro realizada que te elimina las filas.
Saludos