Aqui hay un buen listado de herramientas clasificadas por tipo para hacer sitemaps de todos los colores
http://code.google.com/p/sitemap-gen...emapGenerators
Yo uso el de AuditMyPC porque es el primero de la lista, no por otra cosa, te permite editar bastantes opciones, no recuerdo si te pemite bloquear carpetas pero podrías en todo caso bloquearlas con el robots.txt para el user agent de AuditmyPC antes de hacer el sitemap, dándole acceso solo a esa carpeta ....como primera ocurrencia para resolverlo.