Si tratas de mostrar todo eso dos veces en una misma pagina, es logico que no funcione, porque cuando el navegador lee
</html> lo interpreta como fin de pagina y lo que siga despues puede ignorarlo o (si se trata de IE) hacer alguna extravagancia.
Lo mejor es que ubiques que es exactamente lo que necesitas tener dos veces y lo copies dentro del mismo documento a ver si funciona.
P.D. Seguro que esto tiene que ver con PHP?