hola merino en las wmtools lo que te da es una media de las posiciones que ocupa alguna url de tu web, con los filtros que tengas. Si no asignas filtros, ves un resumen de lo mas importante segun google (en el grafico) y las medias totales. Osea puede ser que ahi te aparezca que estas el 250 para tal keyword, pero para españa estes en primera pagina (hombre, es rara tanta diferencia) pero para que te hagas a la idea.
Si en la lista general de Consultas, con o sin filtros da igual, pinchas en una keyword, te dirá qué URL/s están saliendo en las búsquedas por esa key, posicion media y los numeros de impresiones/ctr y demas en cada uno de los rangos (para la 1º,2º,3º,4º,5º y de la 6º a la 10º y más allá).
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