Por lo que entiendo no necesitas saber mucho de php para dar solucion al problema que te planteas, es decir si entendi bien,
dices que en el menú del lado izquierdo quedo bien pero no querias la barra de scroll???
Pues es simple, en lugar de usar página con la extención
.html, seria
.php, y
en lugar de usar iframes usarías un solo include, el cual funciona similar al iframe con la diferencia de que no tiene barra de desplazamiento y se ajusta al div donde lo coloques, todo el funcionamiento es el mismo de html (claro a menos que metas funciones y demás).
Nota: desde el include (que es una nueva página) que se añade a tu web que sería el "menú"
bastaría con cambiar o editar solo este para que en todas las páginas de tu sitio se cambiaran