Hola:
Si window.open solo lleva un parámetro, tiene que ser una url válida, pero si en un popup quieres escribir código, debes abrir una ventana vacía, y en ella escribir con write...
v = window.open("");
//v.document.clear();// esto en ventanas nuevas es innecesario...
v.document.open();
v.document.write(aj.responseText);
v.document.close();
Saludos