Modificar value="" al hacer click en un boton de borrar

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Perdon por haber contestado sin haberlo testeado al 100%. Te comento los pasos que he seguido

1 - Elijo opción Select
2 - Marco algunos checkbox
(Hasta aquí todo bien)

3 - Borro formulario
4 - Vuelvo a elegir opción del Select
(aquí ya empieza a fallar)
5 - Marco algunos checkbox
(esto funciona siempre a la perfección)
6 - Borro formulario otra vez
7 - Vuelvo a elegir opción del Select
(sigue fallando, al borrar el form y al elegir otra vez alguna opción del select pues se queda colgado, aveces resta la cantidad etc...)

He tratado de dejar el código tal cual estaba y tan solo añadiendo la funcion limpia(); pero nada, no hay manera.

A ver si me echais una manita, gracias!