Que tal 
Lopezito, 
Desde mi ignorancia en WP, te comento un par de cosas, estas cargando dos veces la librería, 
esto:    
Código PHP:
Ver original- <?php wp_enqueue_script("jquery"); ?> 
te carga la versión built-in de jquery y ten en cuenta que viene en modo 
noConflict, osea para utilizarla deberias hacer algo asi:    
Código Javascript
:
Ver original- jQuery(document).ready(function() { 
-     jQuery('#page_effect').fadeIn(2000); 
- }); 
o asi:    
Código Javascript
:
Ver original- $j = JQuery.noConflict(); 
-   
- $j(document).ready(function() { 
-     $j('#page_effect').fadeIn(2000); 
- }); 
o asi:    
Código Javascript
:
Ver original- (function($){ 
-   
-     $(document).ready(function() { 
-         $('#page_effect').fadeIn(2000); 
-     }); 
-   
- })(jQuery); 
Todo esto teniendo en cuenta que estas colocando el código donde corresponde, si te sigue sin funcionar, comprueba la consola de firebug|chrome a ver que error te tira. 
Saludos.