puedes leer los mails de tu archivo con PHP
fopen(); para abrir archivos
http://www.php.net/manual/en/function.fopen.php
fread(); para leer el contenido
http://www.php.net/manual/en/function.fread.php
así puedes obtener los mails y guardarlos en una BD aunque también puedes mostrarlos en tu web sin guardarlos en una BD
como mejor te convenga