Trabajar con dos conexiones a la Base de Datos

[Uncontroled_Duck]

Buenas,

Tengo una duda, os pongo un poco en situación:

La aplicación tiene un sistema de sesiones controladas con una base de datos, que actualiza constantemente las últimas impresiones de páginas, ip, etc.

Esta conexión es permanente y está activa siempre que hay usuarios conectados. La conexión no es con PDO, me recomendaron que al ser constante, PDO sobrecargaría un poco más, y como no controla campos de formularios etc, el riesgo de inyección es bajo.

Ahora bien, una vez dentro del sistema, si hay que trabajar continuamente con formularios y la base de datos, estas conexiones si las quiero hacer con PDO puesto que la exposición a inyección sql es mayor.

Mi pregunta:
Se pueden tener dos conexiones trabajando al mismo tiempo?

Si la respuesta fuese Si, como tendría que configurarlo?

Saludos y gracias de antemano,