Gracias Keeponfresh por su ayuda, acabo de solucionar el problema, resulta que en las opciones globales tenía activado las URLs amigables, pero no tengo instalado el com_sh404sef, que es el complemento que precisamente convierte las URLs a amigables.
A propósito, yo tenía ese complemento y en una formateada perdí ese complemento, será que no lo tienes y me lo facilites... ahora es pagando
Cita:
Iniciado por keeponfresh 
El problema debe estar a la hora de crear el ítem del menú, deberías probar crear un enlace a mano, y no utilizando la opción de menú... disculpa que no me explique mejor, escribo desde el móvil.