Problema con Contenedores

[AlvaroG]

Si no sabés usar glade u otros diseñadores de interfaces, te recomiendo que lo aprendas.
Saber escribir el código del a interfaz es útil muchas veces (en aquellos casos donde el diseñador se queda corto), y definitivamente didáctico, pero para cosas complejas perderás mucho tiempo.

Contestando la pregunta, lo que buscás no es un contenedor sino un Layout (literalmente "disposición", un gestor de elementos en la ventana)
No conozco GTK, pero si tenés VBox seguramente tengas HBox (horizontal), y puedas combinarlos (poner varios hbox dentro de un vbox, obtenés tres filas horizontales de elementos). Seguramente tengas también un GridBox (grid = rejilla) que te provee filas y columnas para ubicar elementos.

El resultado que ves con el VBox es esperable. Usualmente los VBox se limitan a colocar los elementos que les incluyas con la misma altura (dividida de la altura total) y ocupando todo el espacio vertical. Lo mismo hará el HBox.
Sin embargo, se puede indicar al VBox cuánto espacio debe ocupar cada elemento, fijate en la documentación.

saludos.