A ver, ¿si te fijas lo que escribes?
Cita:
Iniciado por MOiSTER 
[...] es un problema con el Javascript SDK de Facebook, ya que IE me muestra el siguiente mensaje [...]
¿Entonces?
Cita:
Iniciado por MOiSTER mm creo que por que estoy usando el Facebook PHP SDK, como base crear la conexión entre mi sitio y el Facebook.
¿El error que recibes, lo recibes en PHP o en el navegador?
Dependiendo de tu respuesta debes tomar una decisión.
¿El problema es de PHP o Javascript?
PDTA: recuerda que PHP se ejecuta en el servidor, no en el navegador, por lo tanto no debería afectar en nada.