creas una funcion javascript para que te mande aun archivo donde tengas lo necesario para borrar.
Código Javascript
:
Ver originalfunction eliminar(id)
{
if(confirm("¿Realmente deseas eliminar esto?"))
{
window.location="eliminar.php?id="+id;
}
}
en tu enlace haces esto:
<a onclick="eliminar('id')" href="javascript
:void(0)">Enlace</a>
donde id es dinamico y es el parametro que pasará a tu archivo php que hara la consulta necesaria para borrar el elemento que tiene tal id en la base de datos.