Podrías meter el span dentro de un objeto alineado en centro y así luego puedes ubicarlo tomando como referencia dicho centro, así:
Código:
<div id="estoyCentrado">
<span></span>
</div>
CSS
Código:
#estoyCentrado
{
position:relative;
margin: 0 auto;
}
#estoyCentrado span
{
position:absolute;
top: ##px;
left: ##px;
}