Las puedes encontrar todas en el manual:
http://cl.php.net/manual/en/ref.filesystem.php
Pero te doy un truco, si usas dreamweaver, con Shift+F1 (o Mayus+F1) o arriba en Ayuda>Referencia, se incluyen referencias para todos los códigos web, incluye: CF, CFML, ASP, HTML, JS,
PHP, SQL, UsableNET, JSP y otros.
Seleccionas cual quieres y te aparecerán la mayoría de las funciones, elije PHP y luego "
Filesystem Functions" y obtendrás ayuda de todas las funciones sin tener que abrir el manual.