Hola bienpiyao, despues de tu consulta debes hacer un while para que recorra toda la tabla y luego pasar esa variable al grafico, algo asi:
Código PHP:
$query = mysql_query("SELECT votos,candidato FROM encuesta");
while($row = mysql_fetch_array($query))
{
$data[] = $row[0];
$can[] = $row[1];
}
espero te sirva