Tal como menciona Roger, una de las opciones la representa functions.php. Este archivo tiene la particularidad de activar las funciones propias de WordPress (cosa que no logras con un archivo extraño).
Si deseas crear un sistema de archivos aparte y -al mismo tiempo- contar con las funciones de núcleo del software, puedes armar tu código con total libertad y luego
hacer los require desde functions.php.
El punto en contra de usar este archivo: si deshabilitas el theme se vuelan tus funciones. Para que esto no te pase puedes echar mano de
la otra opción: construir un plugin.
Como dato extra, la parte dinámica también tiene su "hierarchy": El sistema lee primero functions.php y luego el plugin.
Cita:
Iniciado por carlos_belisario 
cual es la mejor forma de agregarlas a este?? colocandola dentro de la carpeta includes??
Blasfemo
