Primera cosa, estás hablando de errores que te da el editor que usas sin decir cual es, y cuanta más información des, más fácil será ayudarte.
Cita: class file editor
the jar file "rt.jar" has not source attachment.
Esto no tiene que ver con el error, ya que si no estuviera la librería, el error sería que no encuentra la librería, no que no encuentra el fichero. Esto tiene que ver con que no has reinstalado del todo bien eclipse, y no puede mostrarte correctamente el código fuente de funciones de rt.jar en modo debug.
Pero es algo que no te afecta, ya que lo normal que no necesites debuggear el código fuente de java.
El problema está donde te he dicho, estás juntando "c:\subidos" + "C:\Documents and Settings\Jorge\Mis documentos\PROYECTO\ManualXML.pdf" para crear una ruta.
Aunque tenías razón en una cosa (no has tocado el código), es necesario que crees un método para quedarte sólo con la parte del nombre del archivo. Fíjate, gracias al formateo has detectado un error de "código".
Pista: ¿A que no has usado tu navegador habitual?