alid,
lo que debes hacer es lo siguiente
La función js que usas no te sirve si por nombre de ventana tiene una variable. Lo primero es que la ventana tenga un nombre conocido. Cambia tu función por ésta que es la misma pero modificada:
<script LANGUAGE="JavaScript">
function popUp(URL) {
ventanita= window.open(URL,'ventanita', 'toolbar=0,scrollbars=1,location=0,statusbar=0, menubar=0,resizable=0,width=560,height=240')
}
</script>
a tu tag de form ponle lo siguiente
<form action ="encuesta/proceso.php" method = "post" onsubmit="popUp('')" target="ventanita">