Porque usas ese y no el oficial
http://dev.mysql.com/downloads/connector/net/
digo al final de cuentas el que ofrece mysql en su sitio es estable y cumple con el estandar de perfomance minimo.
digo eso como primer paso de ejecucion y despues seria cuestion de revisar tambien tu cadena de conexion y como consumes tus conexiones (abrir, ejecutar, cerrar) correctamente en todas tus invocaciones.