es como mencionas.
Los porcentajes (%) se adaptan a cualquier resolucion (es decir, crecen y disminuyen).
Los pixeles (px) son estaticos, es decir, no modifican su dimension.
Y ahora, yo acostumbro usar px, y rara vez porcentajes (dependiendo el motivo).
Y una de las causas por las que uso "px", es que si metes imagenes (las cuales son estaticas con unas dimensiones definidas), y tiene mucho contenido, a la hora de que los porcentajes se redimencionen demasiado, te enviara cosas hasta abajo, las imagenes se saldran de sus respectivos divs, y se descuadrará muy feo tu sitio.
Asi que preferiblemente y a mi opinion, uses pixeles.
Saludos
