Tienes multiples opciones para generar estadísticas de acceso web en función de como realices ese acceso...
Por ejemplo, si lo que tienes es un servidor web como apache (yo no usaría otro salvo para webs extremadamente ligeras en máquinas muy poco potentes tipo router) o IIS, puedes configurar algo tipo: awstats (open source)
http://awstats.sourceforge.net/
Si quieres registrar a donde se dirige cada PC (y van a servidores diferentes sobre los que no tienes control, como Internet) lo mejor es montar un proxy de red (squid va de miedo) y usar una herramienta similar (el mismo awstats podría valerte) o algo tipo sarg o logsurfer o...
Lo dicho. Tienes infinidad de analizadores de logs. La decisión sobre cual usar va en función de la herramienta cuyos logs vayas a analizar, lo profundo y/o complejos que quieres que sean esos logs, lo hábil que seas en temas de sistemas para configurar el analizador (algunos son más fáciles de tener funcionando sin muchos conocimientos) y, finalmente, tus preferencias personales.